Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms