Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ANKRD39Q53RE8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms