Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms