Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF3Q3KNV8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms