Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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