Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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