Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM187BQ17R55 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms