Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PDK4Q16654 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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