Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPE65Q16518 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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