Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1EQ15878 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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