Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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SS18Q15532 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SS18Q15532 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SS18Q15532 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SS18Q15532 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SS18Q15532 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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SS18Q15532 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SS18Q15532 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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