Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CDSNQ15517 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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