Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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