Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPNMBQ14956 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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