Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SQLEQ14534 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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