Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE1CQ14123 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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