Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
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SHROOM2Q13796 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
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SHROOM2Q13796 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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