Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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TUBB3Q13509 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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