Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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ITGB3BPQ13352 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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ITGB3BPQ13352 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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