Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms