Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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