Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms