Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms