Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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