Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms