Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREMQ03060 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREMQ03060 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CREMQ03060 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CREMQ03060 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CREMQ03060 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CREMQ03060 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREMQ03060 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms