Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms