Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms