Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPCQ01831 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms