Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms