Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MTTPP55157 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTTPP55157 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTTPP55157 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms