Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRP9P49458 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms