Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIA4P48058 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms