Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC135068.6-201ENST00000625294 622 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 OR2A42-201ENST00000391496 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 OR2A1-201ENST00000408951 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC00525-201ENST00000412730 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL031282.1-204ENST00000418950 497 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC009090.1-201ENST00000562409 358 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BEAN1-AS1-203ENST00000569125 530 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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