Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms