Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BMP4P12644 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BMP4P12644 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BMP4P12644 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BMP4P12644 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BMP4P12644 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms