Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRP12270 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms