Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms