Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUP10909 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms