Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI2P10070 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI2P10070 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI2P10070 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI2P10070 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI2P10070 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI2P10070 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI2P10070 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI2P10070 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI2P10070 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI2P10070 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI2P10070 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI2P10070 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI2P10070 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI2P10070 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI2P10070 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI2P10070 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms