Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2AF1L5P0DN76 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms