Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms