Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms