Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms