Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP19O94966 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
USP19O94966 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP19O94966 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP19O94966 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP19O94966 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms