Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTRA2O43464 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms