Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRODHO43272 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRODHO43272 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms