Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD9O15198 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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