Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms