Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3CA6NKF2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms